Aunque la FDA no ha eliminado ningún desinfectante líquido que usa alcohol como agente primario para su uso en entornos clínicos, el alcohol isopropílico ha demostrado ser eficaz para matar microorganismos en ciertas condiciones, según los Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades. Entre los diferentes tipos de alcohol disponibles para la esterilización, el alcohol isopropílico es uno de los más bactericidas.
Según lo informado por los CDC, se realizaron ensayos clínicos con alcohol metílico, alcohol etílico y alcohol isopropílico para determinar su efectividad relativa en la esterilización de superficies. Todas las formas de alcohol sufrieron una disminución significativa en la efectividad cuando se diluyeron a concentraciones por debajo del 50 por ciento. Ninguno demostró ser capaz de matar esporas bacterianas o penetrar en capas de proteínas gruesas. Sin embargo, entre las variedades probadas, el alcohol isopropílico demostró la capacidad de matar los virus tanto de la hepatitis B como del herpes. Fue ligeramente más eficaz que el alcohol etílico para desinfectar las poblaciones de E. coli y S. aureus.
También se encontró que el alcohol isopropílico fue efectivo en la desinfección de cabezas de transductores reutilizables. El CDC advierte, sin embargo, que los germicidas a base de alcohol generalmente no se recomiendan para la esterilización de implementos quirúrgicos. Esto se debe a que ninguno de los agentes probados fue capaz de eliminar de forma confiable las esporas de varios bacilos, y en ocasiones las infecciones fatales se deben al uso de implementos tratados con alcohol.
