Los perros legendarios, Raikou, Entei y Suicune, comienzan a aparecer al azar en el pasto silvestre una vez que el jugador ha vencido a la Elite Four y ha obtenido acceso al Ferry de la Isla Sevii. El jugador solo puede atrapar a uno de los tres en cualquier partida dada, y depende del Pokémon iniciador.
Si el jugador elige a Squirtle como el Pokémon inicial, Raikou aparece en el juego. Si el jugador elige Bulbasaur como el abridor, aparece Entei; Para Charmander, es Suicune. Todos los perros legendarios se encuentran al azar en el pasto silvestre, y su ubicación cambia cada vez que el jugador ingresa a un edificio o se muda a un área nueva. La mejor manera de encontrarlos es viajar arriba y abajo en algunas de las rutas más largas en áreas múltiples del juego.