Windex contiene sustancias químicas nocivas, como el hidróxido de amonio, el hexoxietanol y la fragancia de la sustancia química, según el Environmental Working Group. El limpiador de cristales también contiene propilenglicol, una sustancia controvertida utilizada en la pasta de dientes y en los cosméticos. Daily Finance afirma que SC Johnson creó un sitio web en marzo de 2009 que explica muchos de los ingredientes de los productos de limpieza de la empresa.
El hidróxido de amonio es un irritante respiratorio conocido que puede dañar la vista y la piel. El EWG también indica que el hidróxido de amonio causa toxicidad acuática aguda. El hexoxietanol puede afectar a los órganos, mientras que la fragancia puede provocar alergias, irritación de la piel y problemas del sistema nervioso. EWG menciona a Windex como una preocupación moderada por los asmáticos y por aquellos que sufren de enfermedades respiratorias. La irritación de la piel es otra preocupación que los científicos tienen con respecto al limpiador de vidrios.
Daily Finance señala que Windex utiliza propilenglicol, una sustancia considerada segura por la Agencia de Protección Ambiental de los Estados Unidos. Los ambientalistas argumentan que los estudios muestran que el propilenglicol causa daño renal y hepático.
Forbes informa que un estudio exhaustivo de productos de limpieza para el hogar, incluido Windex, llegó a la conclusión de que muchos productos tienen un amplio espectro de efectos para la salud. Uno de los efectos de salud más notables fue el asma, mientras que otro fue la alteración endocrina.
El sitio web oficial de What's Inside SC Johnson enumera varios ingredientes de su limpiador de cristales Windex. Agua, alcohol isopropílico, 2-hexoxietanol, Videt EGM, sodio c14-17 sec-alquil sulfonato, hidróxido de amonio, propilenglicol, Mirapol Surf S-10, fragancia y Liquitint Sky Blue Dye están en una botella de Windex.