Una de las desventajas de usar Joint Application Development es que las partes interesadas pueden abordar los desafíos erróneos de desarrollar aplicaciones porque asistieron a la reunión sin estar preparados. Del mismo modo, la selección de personas para participar en los foros puede alterar o sesgar los resultados. Si esto sucede, todo el proceso de desarrollo de aplicaciones puede verse comprometido. Otra desventaja es que puede haber recursos insuficientes para la resolución de problemas.
Joint Application Development (JAD) es un enfoque para desarrollar sistemas al incorporar la experiencia del usuario final en el proceso. Los defensores de la idea argumentan que la mala comunicación entre los desarrolladores de sistemas profesionales y los usuarios del sistema representa la mitad de todos los errores del sistema. A pesar de las desventajas anteriores, JAD ha ayudado a los profesionales de TI a desarrollar sistemas y aplicaciones más eficientes. En particular, la mayor ventaja es que los participantes provienen de diferentes departamentos de una organización. El hecho de que provengan de niveles variados de conocimiento significa que conllevan necesidades diferentes que deben cumplirse. Incluso con los inconvenientes, este enfoque ha sido considerado como un excelente método de resolución de problemas. Emplea el uso de herramientas de investigación y comunicación tales como entrevistas, grupos focales y cuestionarios. Si bien las entrevistas son largas y costosas, es imposible capturar pistas no verbales de los encuestados mediante cuestionarios.
