El aeropuerto central de Allegiant Air es el Aeropuerto Internacional McCarran de Las Vegas. La aerolínea también opera desde diferentes bases en otros estados, como Florida, Texas, California y Hawai.
AllegiantAir.com presenta un mapa interactivo que muestra las diversas rutas de la aerolínea. Los usuarios pueden pasar el mouse sobre un punto naranja o azul para leer el nombre del aeropuerto que representa y luego hacer clic en el punto para ver los vuelos desde y hacia el aeropuerto. Las rutas activas aparecen en líneas grises sólidas, y las rutas estacionales aparecen como líneas discontinuas. La aerolínea Allegiant vuela principalmente desde aeropuertos más pequeños a áreas de vacaciones. Todos los vuelos son sin escalas.