Las aplicaciones gratuitas de Amazon Appstore son seguras de descargar, siempre que se descarguen directamente desde la tienda. Estas aplicaciones pasan por un proceso de investigación similar al de Google Play.
Aunque las aplicaciones de Amazon Appstore son seguras, el proceso de instalación introduce vulnerabilidades de seguridad para los usuarios de Android. Para instalar aplicaciones, los usuarios deben cambiar la configuración de seguridad del dispositivo Android para instalar aplicaciones de fuentes desconocidas, un proceso conocido como carga lateral. Una vez configurado, el dispositivo Android permite a un usuario instalar una aplicación independientemente de su origen, no solo desde Amazon Appstore. No hay una función actual de Android que permita solo aplicaciones de un mercado específico.
La mayoría del malware proviene de sitios de terceros, aunque también puede enviarse como archivos adjuntos en los correos electrónicos. Por lo general, un dispositivo Android defiende al usuario al negarse a instalar cualquier aplicación que no se originó en Google Play. Sin embargo, esta función está deshabilitada en el proceso de instalación de aplicaciones desde Amazon Appstore, lo que crea una vulnerabilidad de seguridad. Hay miles de aplicaciones maliciosas de Android actualmente en circulación, y la mayoría provienen de sitios de terceros.
Para evitar este problema, los usuarios deben volver a habilitar la función de seguridad y no permitir instalaciones de fuentes desconocidas tan pronto como se instale la aplicación de Amazon Appstore. Esto protege el dispositivo cuando no se cargan las aplicaciones previstas.