Los católicos romanos y los bautistas del sur difieren en sus creencias acerca de la autoridad absoluta, el bautismo, la Biblia y la absolución. También creen de manera diferente sobre el valor y el significado de la Comunión y cuánta autoridad para dar a los líderes de la iglesia.
Mientras que los católicos romanos creen que los líderes de la iglesia tienen autoridad absoluta, los bautistas del sur creen en la máxima autoridad de la Biblia. Lo ven como un manual de instrucciones para vivir como Dios quiere y no creen que tenga errores. Los católicos romanos no creen que la Biblia sea infalible. Creen en la verdad de la Biblia tal como la interpreta la iglesia. También encuentran la verdad en sus tradiciones.
Los bautistas del sur consideran que el bautismo es completamente simbólico y un medio de testificar acerca de ser salvo, no un medio de ser salvado. No bautizan a los infantes. Los católicos romanos bautizan a los bebés y consideran el bautismo como un sacramento y un requisito previo para la salvación.
Los bautistas del sur toman la comunión para honrar y recordar la muerte de Jesús, mientras que los católicos romanos ponen un mayor significado en el sacramento de la comunión. Creen que las obleas de la Comunión representan el cuerpo de Cristo y que el vino representa su sangre, y al tomar la Comunión, se acercan más a Dios.
Los católicos romanos creen que el Papa es infalible y reconocen la jerarquía dentro de la iglesia, permitiéndole dictar cómo operan las iglesias individuales. Los bautistas del sur no creen que los obispos tengan un poder absoluto. Sus iglesias operan sin instrucción y llevan a cabo los negocios que consideren adecuados.