"IGI-2: Ataque encubierto" contiene 19 misiones para un solo jugador que van desde vigilancia encubierta y escapes hasta atracos y asaltos a gran escala. Las misiones se realizan en una amplia variedad de espacios interiores y exteriores. ubicaciones El jugador puede elegir cómo se acerca y completa cada misión.
Cada misión tiene un objetivo, y hay múltiples caminos disponibles para lograr cada uno de estos objetivos. Debido a que el jugador es superado en número en todas las misiones, los enfoques sigilosos suelen ser los más efectivos, pero cada jugador puede elegir cómo desea jugar en una misión por misión. Los niveles de dificultad se establecen al comienzo de cada juego, y las escenas de corte preceden y siguen cada misión para contar la historia del juego.
