Las tarjetas de Pokémon raras incluyen la primera edición de la tarjeta holográfica de Charizard, la tarjeta holográfica de prelanzamiento de Raichu y la tarjeta de Illustrator Pikachu. Las tarjetas de Charizard y Raichu se lanzaron ambas en juegos, una tarjeta promocional.
La primera edición de la carta holográfica de Charizard llegó en el primer conjunto de cartas de Pokémon. Una versión sin sombra de la tarjeta, que no tiene el bisel sombreado estándar en la imagen principal, es la versión más rara y valiosa. Las versiones sin sombra de la tarjeta con un alto grado de condición valen más de $ 1,000, a partir de 2015.
La tarjeta de prelanzamiento Raichu tiene la palabra "Presentación" estampada en la esquina inferior derecha de la imagen principal. Solo ocho de las tarjetas de Raichu tienen este sello, lo que hace que valga alrededor de $ 10,000.
CoroCoro, una revista que una vez vendió Pokémon, creó las tarjetas Illustrator Pikachu. Dio las cartas, que tienen una imagen de Pikachu sosteniendo un pincel, a los ganadores de un concurso de ilustración de cartas Pokémon. Solo seis de estas cartas existen. Las tarjetas de Pikachu de Illustrator sin graduar se venden por $ 20,000, y las que tienen un alto grado valen mucho más.
La mayoría de las tarjetas Pokémon tienen un icono de rareza en la esquina inferior derecha. Este icono de rareza indica con qué frecuencia aparece la tarjeta en paquetes de refuerzo.