Los jugadores no pueden atrapar a Kyogre en el juego en Pokémon Soul Silver. Sin embargo, los jugadores pueden transferirlo por medio de Pal Park desde otros juegos de Pokémon.
En Pokémon Heart Gold, los jugadores pueden encontrar Kyogre en la Torre incrustada, a la que se puede acceder desde una cueva en la Ruta 47 si los jugadores tienen el Blue Orb. Cuando los jugadores alcanzan el mismo punto en Soul Silver con el Red Orb en su poder, encuentran a Groudon esperándolos.
Los jugadores solo pueden obtener Kyogre en Soul Silver cambiando por él o importándolo de otro juego. Kyogre está disponible en la Cueva de origen en Pokémon Sapphire, o en la Cueva Marina en Pokémon Esmeralda. Sin embargo, como estos juegos solo estaban disponibles para la Game Boy Advance, requieren un modelo de Nintendo DS que tenga la ranura para cartucho adecuada. Los jugadores que tengan un modelo DSi o 3DS no podrán obtener Kyogre de esta manera y deberán cambiarlo por él o usar una copia de Heart Gold.
Kyogre es un Pokémon legendario, y en todos los juegos comienza en el nivel 50. Los jugadores deberán estar en un nivel bastante alto para ganar la batalla, y deberán estar preparados para fuertes ataques de hielo y agua.
