Los archivos BIOS como ROM1.bin y SCPH1000.bin deben colocarse en la misma carpeta donde se almacenan las ROM para que funcione PS2emu. Los BIOS son necesarios para que funcione cualquier emulador de PS2. BIOS significa "sistema básico de entrada /salida", y se usan en más que solo emuladores PS2.
Hay varios archivos de BIOS disponibles para los emuladores de PS2. Esto incluye SCPH1000.bin, SCPH100.bin y SCPH7003.bin. Los jugadores solo necesitan uno de estos archivos para hacer funcionar un emulador de PS2. Cada archivo BIOS está relacionado con una región diferente en la que se lanzó la PS2. Por ejemplo, SCPH1001.bin es el archivo de BIOS para PS2 que se lanzó en Estados Unidos, mientras que SCPH1000.bin y SCPH7003.bin son para las versiones japonesa y europea, respectivamente.