La tinción primaria se usa en la tinción de Gram para detectar bacterias Gram-positivas. La mancha primaria es un color violeta cristal. Cuando una bacteria es gramnegativa, pierde la mancha primaria y toma la mancha secundaria de safranina.
Las diferencias en el grosor de la capa de peptidoglicano de la membrana celular de las bacterias hacen posible distinguir Gram-positivo de Gram-negativo. Las bacterias que son grampositivas tienen una capa de peptidoglicano más gruesa y pueden conservar el color primario del cristal violeta.
La tinción de Gram es un proceso de tres pasos que implica tinción primaria, decoloración para deshidratar la capa de peptidoglicano y tinción secundaria para determinar el tipo de bacteria.