Es posible colocar canciones en un iPod sin iTunes utilizando otro software que permita la transferencia de música desde una computadora al dispositivo. Hay alternativas a iTunes disponibles para Windows, Linux, y sistemas OSX.
Hay opciones de software de terceros para los propietarios de iPod que desean transferir música a su dispositivo sin usar iTunes. Estas opciones requieren que los usuarios descarguen el software a su computadora. Conecte el iPod y active el software instalado. Las opciones de freeware como SharePod o PodTrans permiten al usuario ver copiar o mover archivos de música desde una computadora con Windows al iPod. Podworks y PodUtil tienen el mismo propósito para OSX y Linux respectivamente. Cada programa tiene una interfaz a través de la cual los usuarios seleccionan la ubicación de la música en su computadora, ya sea que quieran copiarla o transferirla, y dónde quieren guardarla en el iPod.