Los hexágonos aparecen en la naturaleza en muchos lugares, como las células entrelazadas de una colmena y los cristales de un copo de nieve. Las conchas de tortuga a menudo están cubiertas con marcas hexagonales. The Giant's Causeway en Escocia es una característica geográfica compuesta por 40,000 columnas hexagonales de basalto. Los hexágonos se usan comúnmente para azulejos, adoquines y otros revestimientos de paredes y pisos, mientras que los paneles solares a menudo se componen de rejillas hexagonales.
La aparición natural de hexágonos se debe a la forma eficiente en que la forma hexagonal hace uso del espacio. El hexágono es uno de los tres polígonos regulares que se unen para cubrir una superficie plana sin espacios, los otros dos son el cuadrado y el triángulo equilátero.
Debido a que un hexágono tiene más lados que un cuadrado o un triángulo, su área tiene un perímetro fijo más compacto que cualquiera de los dos. Esto significa que las celdas hexagonales de nido de abeja utilizan la menor cantidad de cera necesaria para encerrar la máxima cantidad de espacio, sin desperdiciar espacio entre las celdas.
Una disposición hexagonal también permite el empaquetado denso de objetos circulares. Por ejemplo, las canicas colocadas en un plato redondeado se organizan naturalmente en forma hexagonal, con seis canicas agrupadas alrededor de una canica central.
