En el videojuego "Fallout 3", la Ciudadela está ubicada cerca del extremo oeste del Arlington Memorial Bridge en las ruinas de Washington, DC Es aproximadamente al sureste de la ubicación de inicio del juego, la Bóveda 101, a lo largo del lado oeste de el rio potomac Los jugadores no pueden acceder a él hasta que hayan completado ciertas misiones.
Los jugadores deben completar la misión "Las aguas de la vida" antes de poder acceder a la Ciudadela. Esta búsqueda es parte de la rama principal de la historia del juego. La puerta de la Ciudadela se encuentra entre la entrada al río y la entrada al centro comercial de las ruinas del Pentágono, pero está fuertemente protegida por la Hermandad del Acero, y no la abren hasta que un evento en la trama lo obliga a hacerlo. El jugador no puede abrirse paso porque no hay forma de abrir la puerta manualmente, y es la única entrada a la Ciudadela.
Para alcanzar el punto en el que se puede abrir la puerta, los jugadores deben completar la secuencia de búsqueda para encontrar a su padre, que comienza con "Seguir sus pasos" en Megaton y concluye con "Tranquility Lane" en la Bóveda 112 hay cinco misiones en esta secuencia, pero una de ellas, "Galaxy News Radio", se puede omitir. Es necesario completar "Tranquility Lane" para comenzar "The Waters of Life".