Hay muchos servidores "Minecraft" dedicados al paquete de modificaciones Pixelmon, cada uno con sus propias ventajas. Para jugar, primero instale el paquete de modificaciones Pixelmon a través del iniciador técnico o el cargador de modificaciones Forge, y luego elija un servidor para unirse.
El paquete de mod Pixelmon modifica el juego de "Minecraft" para crear un híbrido con el juego "Pokémon". A los usuarios principiantes se les pide que escojan un Pokémon inicial y luego se les da rienda suelta para luchar y capturar a otros Pokémon. Las bolas de Poké están hechas a mano con apricornios, lingotes de hierro y botones de piedra. Para luchar contra un Pokémon salvaje o un compañero entrenador, lanza una Poké Ball y golpea al oponente que desees. Esto abre el menú de batalla.
Al unirse a un servidor Pixelmon, surgen nuevas opciones para jugar. El comercio está disponible, al igual que los eventos, concursos y grupos de construcción. Algunos servidores personalizan el juego aún más eliminando daños de caída, hambre y turbas naturales "Minecraft". Otros servidores se centran más en el entorno y crean estructuras elaboradas para los PokéCenters y los gimnasios. Desde el 12 de julio de 2015, los tres servidores principales de Pixelmon en Pixelmonservers.com son DestinyMC, RC-Pixelmon y PPMC Pixelmon Network.
Muchos servidores Pixelmon de gran volumen ofrecen servicios de pago, como un aumento en el rango de los jugadores o artículos raros en el juego. Estas ofertas y tarifas varían.